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为什么进化有年龄歧视

在生育年龄之后,基因突变从适应性转变为危险。

每当病理学家乔治·马丁俯身看着一具刚死的尸体时,他就会思考摆在他面前的多样性。虽然他的尸体几乎…艾米·马克斯曼著

E每当他俯身看着一具刚死不久的尸体时,病理学家乔治·马丁就在思考着摆在他面前的多样性。尽管他的尸体几乎都是老人的,但变化很大。一个人的肠子里长了息肉。另一个人的动脉被斑块堵塞了。甚至在同一类型的疾病中也存在多样性。例如,患有阿尔茨海默氏症的人大脑中β淀粉样蛋白沉积的位置就明显不同。如果每种疾病都有相同的潜在原因,那么被这种原因蹂躏的尸体在死亡时看起来应该是相似的。但是他们没有。“我从未见过两个人以同样的方式变老,”马丁说。

马丁读了所有他能读到的关于衰老的书。他特别感兴趣的是观察从无性繁殖的酵母到人类双胞胎的生物体,它们的寿命是如何大相径庭的。一个更引人注目的例子是关于微小蠕虫的报道,秀丽隐杆线虫即使这些蠕虫在基因上是相同的,并且生活在相同的实验室环境中,它们的寿命也会有5倍的变化。

来自地窖的传说:研究衰老遗传基础的乔治·马丁(George Martin)对尸体讲述的人们衰老和死亡方式感到惊讶。“我从未见过两个人以同样的方式变老,”他说。 约翰试行

生物学家知道环境中的偶然性事件(例如被公交车撞)是如何影响寿命的。他们也了解偶然在遗传学中的作用(例如遗传亨廷顿舞蹈病和某些癌症的基因)。但现在,随着动物年龄的增长,似乎出现了第三个不确定性领域,导致它们以不同的方式衰老。研究人员才刚刚开始弄清楚随着时间推移而形成的生物波动的基础。有些是由于在细胞复制时,突变滑入了基因组。另一些则是由于分子的变化关闭或激活了基因。

细胞核内随机变异的位置很重要,这也可能是由偶然决定的。它们就像在蓝图上形成的小泪水,随着时间的推移,蓝图被草率地折叠、展开、再折叠。根据皱褶发生的地方,蓝图编码的建筑要么保持完整,要么变得容易倒塌。

就像一阵风吹进一家玻璃商店一样,机会决定了破坏的程度。

为什么进化会让这种不稳定性在我们的生物结构中持续了无数年呢?现年89岁的马丁目前在华盛顿大学(University of Washington)研究衰老的遗传基础,他和其他一些研究衰老的研究人员推测,有限的内部不确定性是有益的,因为它有助于动物适应不断变化的环境。

这一概念与多样性在进化中至关重要的作用的更广泛的图景相吻合:种群中个体之间的差异为自然选择提供了选择的选项。毕竟,如果在动物遗传了基因之后出现了过多的变异,自然选择就无法清除它们,因为在进化意义上的生存只意味着该谱系在下一代的生存。

正如马丁所说,“在我们有了孩子之后,自然就不再在乎我们了。”自然选择基本上在40岁左右就结束了,而这正是衰老的开始。”

虽然生物体内基因表达的突变和波动可以提供适应性的好处,但随着突变的积累和基因表达波动的幅度越来越大,它们在生命后期就会出现问题。马丁说,反过来,这些机会的变化可能会导致“老年疾病”,包括癌症和退行性脑疾病。


T在我们的一生中,机遇通过微小的、偶然的突变潜入我们的身体。体细胞突变在细胞随时间分裂时发生。在每次分裂过程中,新的DNA链都会出错。与DNA修复相关的基因通常会修复这些突变,但如果时间足够长,其中一个修复基因也会不可避免地发生错误。确切地说,这是一个机会问题——尽管风险会随着时间的推移而增加。但一旦出现这种错误,额外的突变将会持续下去,而不是固定下来。再一次,机会决定了多长的时间,直到其中一个突变随机影响致癌基因。

马丁解释说:“想象一下,你正在向DNA投掷飞镖。“它可能会击中一些你幸运的地方——像我一样,你能活到89岁。或者你也可能像我已故的妻子一样不幸她死于一种从大脑开始的恶性癌症。尽管她的身体状况很好,但她发现了一个显性致癌基因。”

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并非所有的癌症都是偶然引起的。2015年1月,一名生物统计学家和一名癌症遗传学家估计,大约三分之一的癌症病例可归因于遗传缺陷和环境因素(从阳光到香烟)的攻击。剩下的,他们写了信科学可能是由于内部的随机事件,如偶然突变。

最近的研究表明,随着时间的推移,看似微不足道的随机突变可能会成为一个问题。其中一些突变可能会导致基因表达方式的改变。最先进的技术使细胞生物学家能够分析单个细胞内基因表达的微小差异。随着动物年龄的增长,在基因表达方面,体内基因相同的细胞逐渐变得更加不同。

在2006年的一次自然在研究中,研究人员监测了从6个月大的年轻老鼠和27个月大的年老老鼠的心脏细胞中提取的12个基因的表达。基因的激活是通过相应的RNA水平来解释的,因为RNA是基因和蛋白质之间分子途径的中间体。年轻小鼠细胞的RNA水平相对相似。然而,老年小鼠细胞的异质性增加。研究人员认为,这种不一致可以解释为什么年老的老鼠心脏功能较差。“这些结果强调了衰老过程的随机性,”阿尔伯特·爱因斯坦医学院(Albert Einstein College of Medicine)的分子遗传学家简·维杰(Jan Vijg)和手稿的合著者总结道。

西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心的分子生物学家罗杰·布伦特(Roger Brent)对此表示赞同。他解释说:“如果脊椎动物的高级功能依赖于器官或组织内的细胞群体以某种方式作出反应,那么突变意味着反应将不那么一致,这可能导致功能下降。”然而,科学家还没有证明这种噪音会导致心脏病等与衰老相关的疾病。Vijg怀疑确实如此,但他说证据并不容易获得。他解释说:“很难精确地说明细胞之间的变异是如何导致器官功能的丧失的。”

“在我们有了孩子之后,自然就不再在乎我们了。”

早在60多年前,C.H. Waddington就预测波动过大是有害的,并提出存在一种将波动保持在安全范围内的生物机制。他创造了“运河化”这个术语来描述保持稳定的能力。目前,马丁的实验室正在寻找维持体内平衡的基因。他的假设是,这些细胞在生命后期发生了一些事情,增加了老年分子的“漂移”,导致细胞间的变异。马丁说:“这种漂移可能会在生育年龄之后继续存在,如果你的漂移超出了某个内稳态的窗口,你可能就再也回不来了。”

马丁说,他的研究表明,“基因表达的漂移在衰老过程中变得更大”,并可能导致“准随机”的老年疾病。然而,他补充说,尽管有证据表明随着年龄的增长,基因表达的变异性增加,但其背后的确切机制仍有待发现。

与此同时,华盛顿大学(University of Washington)研究衰老相关疾病的研究员亚历山大·门登霍尔(Alexander Mendenhall)正试图找出哪些细胞和器官对日益增长的不一致性最敏感。他说:“我们想弄清楚是什么东西首先偶然出现。”为了实现这一目标,他实验室的研究人员观察了单个活细胞秀丽隐杆线虫蠕虫来了解线粒体、肌肉细胞、排泄细胞和其他成分何时以及如何解体。他说:“一旦有了细胞类型失败的数据,也许我们可以预测特定问题的概率。”


一个在研究细胞出了什么问题的同时,生物学家也在研究个体内部的可变性是如何适应的。虽然非遗传波动与益处之间的因果关系尚未得到证实,但在自然界中,基因相同的生物种群中也存在类似的权衡。生物学家称之为“套期保值”——从那些想要缓冲资金损失、因此将资金投入相反结果的投资者那里偷取了一个词。

打赌对冲的一个例子发生在单细胞,基因相同的种群大肠杆菌细菌。许多微生物在接触抗生素时死亡,但其中生长最慢的微生物似乎能存活下来。研究人员尚不清楚是什么原因导致了微生物克隆体中基因表达的变化,但他们怀疑这种变化已经延续了几代人,因为它有助于该家族的生存。有一些迹象表明,癌细胞群也使用了对冲策略:快速分裂的细胞似乎更容易受到化疗的伤害。

“机遇是研究人员必须处理的问题,不管他们喜欢与否。”

同样,门登霍尔和其他研究人员也显示出基因相同秀丽隐杆线虫蠕虫产生的“热休克”蛋白质的数量各不相同。这些特殊的蛋白质保护其他的蛋白质,所以它们不会在对癌症或高温的触发反应中变形或出错。那些产生更多热休克蛋白的后代更少,但比那些产生更多热休克蛋白的后代更能在环境压力下生存。门登霍尔说,这种变异可能会持续下去,因为它使一个种群中的蠕虫的生理多样化。他已经确定了控制信号系统的基因,他认为这些基因可能是变异的基础。

当许多研究人员考虑基因表达如何变化或漂移时,表观遗传学很快浮现在脑海中。通过表观遗传学,表达改变而不突变的核苷酸组成的基因。具体来说,表观遗传学与两个关键过程有关。其中一种成分涉及组蛋白,DNA缠绕在细胞核内。这些线圈的紧密性暴露或隐藏某些基因,从而使它们表达或不表达,这种情况可以通过“组蛋白因子”的结合来改变,这一过程称为组蛋白修饰。第二个表观遗传成分涉及甲基化合物,它附着在DNA上,激活或抑制潜在基因的表达,这一过程被称为甲基化。

基因洛托:在年轻和年老的生物体之间观察到的表观遗传漂变的程度,使研究人员相信其他因素也在起作用,包括那些随机选择的彩票号码。 汉娜k .李

在过去的十年中,科学家们记录了甲基化和组蛋白修饰模式的变化,这些变化随着生物年龄的变化而变化。由于这些改变会导致基因表达的偏差,一些研究人员将这种现象称为“表观遗传漂变”。

在2012年的报告中美国国家科学院院刊研究人员发现,103岁老人的DNA甲基化程度低于新生儿。而且不只是少一点:百岁老人的基因组上的甲基化点比婴儿少近50万个。在另一项研究中,研究人员将3岁的同卵双胞胎与50岁的同卵双胞胎进行了比较,这对同卵双胞胎在基因组中具有相似的甲基化和组蛋白修饰模式,而50岁的同卵双胞胎在甲基化、组蛋白修饰和基因表达方面存在显著差异。没有人知道这些不同的表观遗传修饰模式的影响是什么,它们只是表明表观遗传改变(已知改变基因表达)可能是基因漂变的原因。

一些外部原因是表观遗传变化的基础,如吸烟。但是,在年轻和年老的生物体之间观察到的表观遗传漂变的范围之广,使研究人员相信还有其他因素在起作用——包括那些像鸽子粪便扔人那样随机的因素。门登霍尔说:“机遇是研究人员必须处理的问题,不管他们喜欢与否。”“这并没有让事情变得那么简单。”

随着突变的逐渐积累,甲基化和组蛋白去乙酰化可能会改变那些无关紧要的基因的激活,或者那些主导DNA修复和癌症控制等重要过程的基因。就像一阵风吹进一家玻璃商店一样,机会决定了破坏的程度。研究人员已经发现证据表明,这种损害会导致与衰老相关的疾病。例如,一些癌症开始时,基因通常抑制肿瘤通过甲基化沉默。

然而,科罗拉多大学(University of Colorado)的分子生物学家汤姆·约翰逊(Tom Johnson)担心,对于表观遗传学在衰老过程中所起的作用,目前掀起的这股热潮缺乏证据推动。大多数基因表达的变异仍然存在,但没有明确的原因。更重要的是,约翰逊指出秀丽隐杆线虫蠕虫根本不表现出甲基化,尽管它们衰老的方式存在巨大的、无法解释的差异。他并不怀疑基因表达随时间的推移而变化——相反,他质疑表观遗传学是一个主要的潜在原因。另一个潜在的机制可能是蛋白质在合成过程中和合成后发生的变化。“我宁愿把(漂移)称为随机的,而不是表观遗传学,”他说,“因为当你说表观遗传学时,你假装你知道发生了什么。”

约翰逊曾在麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)主修物理学一年,他从未因衰老过程中的偶然性干扰而动摇过。“你永远无法精确地测量一个原子的位置,因为在测量的过程中,你移动了它,”他说。他指的是海森堡测不准原理(Heisenberg 's Uncertainty Principle),该原理断言了精确度的极限。“你不可能对任何东西都是完全具体的,即使是单个原子。”

因为Martin和他的同事们还没有确定衰老的偶然性机制,任何在细胞水平上解决衰老的方法都为时过早。(马丁尖锐地说:“如果我们真的想让人们活得更久,我们就应该改善我们的卫生系统,以便实现全民医保。”)尽管如此,科学家们对自然界的偶然性描绘了一幅更全面的图景。正如达尔文所指出的,在生殖年龄之前和期间,多样性可以帮助生物体适应变化的环境,并将它们的基因传递下去。然而,到了生育年龄后,马丁和其他研究人员开始感到这种变异变得越来越无情。大自然的确是个残忍的女主人。她带着简单的指引指引我们上路,然后把我们交给命运。


Amy Maxmen是一位屡获殊荣的科学记者,拥有哈佛大学进化生物学博士学位。她的鹦鹉螺人类起源的特征是出现在2015年最佳美国科学和自然写作。

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